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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。
全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
塞尔维亚“洋教练”在中国文字中寻找“年”味道******
(新春见闻)塞尔维亚“洋教练”在中国文字中寻找“年”味道
中新网威海1月12日电 题：塞尔维亚“洋教练”在中国文字中寻找“年”味道
作者 王娇妮 王晓根
手握毛笔，蘸上墨汁，一撇一捺……12日，来自塞尔维亚的体育教师戈兰在山东威海用两种文字写出了带有美好寓意的“福”字和祝福语。
威海南海新区位于山东半岛最东端，与韩国、日本隔海相望。近几年，随着对外开放的深入推进，不少外国人选择来这里工作和生活。
来自塞尔维亚的戈兰是威海南海新区青苗双语学校的体育老师。三年前，他带着妻子玛雅和他们的3个孩子，来到这里工作生活。
办年货、包饺子、抢红包、串门儿，戈兰对中国过年习俗十分了解。但最让他感兴趣的，还是在中国文字中找“年”味儿。
戈兰一家给中国邻居送春联。 王晓根 摄在威海南海新区观海社区12日组织的写春联活动中，戈兰一家五口齐上阵，依次跟着书法老师写“福”字。对戈兰来说，只写“福”字已远远不够，他还颇具创意地采取“接龙”形式，用母语塞尔维亚语在红纸上写下“健康喜乐、事业顺利、财源滚滚、新年快乐”的祝福语。
经过了3个多小时的努力，100多幅寄托美好寓意的春联铺满地面。喜庆的红纸上，外文字母和中国“福”字的混搭，呈现出“中西合璧”的美好愿景。
戈兰的妻子玛雅则提议学着本地人去“串门子”，送祝福。一家五口拎着春联，敲开邻居家的门。
“新年快乐！”戈兰一家双手作揖说着贺词。“太感动了，头一次接待这么特别的客人，祝你们阖家幸福！”邻居吴月美高兴地说。
回到家后，戈兰迫不及待地将对联“迎喜迎春迎富贵 接财接福接平安”贴在自家门上。“有点歪”“不对，太高了”，三个孩子当起了“质检员”，要求爸爸做到分毫不差，端端正正。
小儿子卢卡还拨通了塞尔维亚朋友的电话：“我们家现在有春联了，等到春节那天，我还要给你打电话拜年，你记得要学习几句吉祥话呀。”卢卡向他的朋友介绍起了中国传统习俗，当起了“中国通”。
戈兰细数起还要为中国年做的准备，“今年我要包具有塞尔维亚特色馅料的饺子给家人们吃。”“我要体验万家寨大集，听说临近过年时候的大集特别热闹。”“最近还有丹顶鹤、天鹅等鸟类来到这里，我要拿着相机记录下来，到时候发给塞尔维亚的家人看。”一件件事填满了他的待办清单。
从中国美食到传统习俗，戈兰一家人入乡随俗。“没待够”是戈兰一直挂在嘴边的话，他去过中国许多城市，最后定居在威海，一家人在这里感受中国传统文化的底色和城市发展的亮色。(完)
（文图：赵筱尘 巫邓炎） [责编：天天中] 阅读剩余全文（）  视觉焦点
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